Защитно-ассоциированный рибонуклеопротеиновый комплекс обратной транскриптазы (DRT) ⇐ Васина Википедия

[wiki_en]

«Рибонуклеопротеиновые комплексы защитно-ассоциированной обратной транскриптазы (DRT)» представляют собой класс прокариотических противовирусных систем, состоящих из ферментов обратной транскриптазы и связанных с ними некодирующих РНК | некодирующих РНК (нкРНК). Эти комплексы функционируют как часть защитных механизмов бактерий|бактерий и архей|архей против бактериофаговой инфекции и характеризуются способностью синтезировать нуклеиновые кислоты.
Системы DRT принадлежат к более широкой группе защитных элементов, связанных с обратной транскриптазой. В отличие от классических обратных транскриптаз | обратных транскриптаз, которые копируют РНК в ДНК с использованием стандартных механизмов, зависящих от матрицы, комплексы DRT часто используют гибридные стратегии, включающие матрицы РНК, белковые матрицы или независимую от матрицы полимеризацию.
== Возможности DRT ==
Рибонуклеопротеиновые комплексы DRT обычно включают:

* Один или несколько белков обратной транскриптазы (RT)
* Структурированная некодирующая РНК (нкРНК)
* В некоторых случаях дополнительные вспомогательные белки

Компонент нкРНК часто играет несколько ролей:

* Шаблон для синтеза ДНК
* Конструктивные леса для сборки комплекса
* Регуляторный элемент, контролирующий ферментативную активность

Рибонуклеопротеиновые комплексы DRT имеют общие черты с несколькими хорошо известными биологическими системами:

* Теломераза: использует внутреннюю матрицу РНК для синтеза повторов
* Системы CRISPR-Cas: механизмы противовирусной защиты, управляемые РНК
* Интроны группы II: мобильные элементы, кодирующие обратные транскриптазы

В отличие от этих рибонуклеопротеиновых комплексов, DRT использует синтез белков и производит повторяющиеся продукты ДНК.

== Репрезентативные системы DRT ==

=== ДРТ2 ===
Системы DRT2 производят длинные повторяющиеся конкатемеры кДНК, в некоторых случаях собирая последовательности, не кодируемые напрямую в геноме. Считается, что связанная с ней нкРНК участвует в процессе синтеза, действуя как матрица или структурный ориентир.
=== ДРТ3 ===
DRT3 является одной из наиболее структурно и механически охарактеризованных систем DRT.

Он состоит из двух различных обратных транскриптаз Drt3a и Drt3b и структурированной нкРНК. нкРНК содержит консервативный мотив ACACAC, который действует как матрица для синтеза ДНК

Drt3a синтезирует цепь поли(GT) ДНК, используя матрицу нкРНК, в то время как Drt3b синтезирует комплементарную цепь поли(AC) без матрицы нуклеиновой кислоты, используя механизм, основанный на матрице белка. Эта система производит двухцепочечную повторяющуюся ДНК.

=== DRT9 ===
Системы DRT9 синтезируют продукты ДНК, богатые поли(А), а также связаны с компонентом нкРНК. Структурные исследования показали, что нкРНК необходима для сборки и активации комплекса, опосредует олигомеризацию обратной транскриптазы.


Подробнее: https://en.wikipedia.org/wiki/Defense_a ... in_complex