Микробетрейс ⇐ Васина Википедия

[wiki_en]

Отдел профилактики ВИЧ/СПИДа

«MicrobeTrace» — это браузерная программная платформа с открытым исходным кодом, разработанная Центрами по контролю и профилактике заболеваний (CDC) для визуализации и анализа молекулярной эпидемиологии и сетей передачи инфекционных заболеваний.
Платформа позволяет интегрировать данные о генетических последовательностях патогенов с эпидемиологической и демографической информацией для поддержки анализа при расследовании вспышек и исследованиях в области общественного здравоохранения.
== Функциональность ==
MicrobeTrace предоставляет интерактивные инструменты для визуализации сетей передачи, полученных на основе данных генетического расстояния, исследования филогенетического дерева и интеграции наборов молекулярных, демографических и эпидемиологических данных. Платформа также поддерживает временной и геопространственный анализ вспышек инфекционных заболеваний. Поскольку он работает в веб-браузере, анализ можно проводить локально, не требуя загрузки внешних данных.
== Приложения ==
MicrobeTrace применялся в исследованиях множества инфекционных заболеваний в различных географических условиях, включая вирусные, бактериальные и паразитарные патогены.
=== ВИЧ ===
Платформа использовалась в молекулярно-эпидемиологических исследованиях передачи ВИЧ, включая расследование вспышек среди людей, употребляющих инъекционные наркотики, в США и анализ динамики передачи в международных условиях.
=== Вирусный гепатит ===
MicrobeTrace использовался в геномных эпидемиологических исследованиях гепатита А и гепатита С, включая обнаружение вспышек и анализ передачи как в общественных, так и в институциональных условиях.
=== Бактериальные и паразитарные заболевания ===
Программное обеспечение также применялось при изучении бактериальных и паразитарных патогенов, включая анализ динамики передачи Neisseria gonorrhoeae, расследование вспышек туберкулеза и генотипирование кластеров Cyclospora cayetanensis.
=== Респираторные вирусы ===
Во время пандемии COVID-19 MicrobeTrace использовался при расследовании вспышек в общественных и институциональных условиях, включая исследования передачи инфекции, связанной с социальными событиями и университетским населением.
=== Другие патогены ===
Платформа также применялась к возникающим инфекционным заболеваниям, включая исследования передачи mpox.
== Наличие ==
MicrobeTrace распространяется как программное обеспечение с открытым исходным кодом и доступно через репозиторий общедоступного кода CDC. Он предназначен для работы в современных веб-браузерах и не требует установки.
== См. также ==

* Молекулярная эпидемиология
* Филогенетика
* Генетическая эпидемиология



Подробнее: https://en.wikipedia.org/wiki/Microbetrace