Мобильная версияСалинирубеллус ⇐ Васина Википедия
-
Автор темыwiki_de
- Всего сообщений: 56128
- Зарегистрирован: 13.01.2023
Салинирубеллус
'''''Salinirubellus''''' — род (биология)|род галофильных (солелюбивых) архей.
Его типовым видом является '''''Salinirubellus salinus''''',, который со своим эталонным штаммом В 2025 году был впервые описан второй вид этого рода — Salinirubelluslitoreus. Ваш эталонный штамм — SYNS196.
== Описание ==
== ''Salinirubellus salinus'' ==
Эталонный штамм присутствует в первом описании типового вида Salinirubellus salinus от 2018 года.
Основные полярные липиды типа '''P'''фосфатидил'''g'''лицеролфосфат|'''p'''фосфатидиловый эфир|'''Me'''этиловый эфир (PGP-Me),
и три неопознанных гликолипида;
В 2018 году было обнаружено, что два наиболее важных гликолипида хроматографически идентичны сульфатированному и несульфатированному маннозилглюкозиловому диэфиру (S-DGD-1 и DGD-1 соответственно).
Содержание ДНК G+C штамма Филогенетический анализ, основанный на генах 16S рРНК и rpoB (последний генетический код | кодирующий β-часть РНК-полимеразы), показал в 2018 году, что это триба отличается от родственных родов Halomarina, Natronomonas, Halorientalis, Salinirubrum и Halobaculum отряда. Галобактериалы.
В целом фенотипические, хемотаксономические и филогенетические характеристики позволяют предположить, что штамм
== ''Salinirubelluslitoreus'' ==
Эталонный штамм SYNS196 второго вида, опубликованный в 2025 году, Salinirubelluslitoreus (предварительный GTDB Salinirubellus sp037335815 с другим эталонным штаммом) был изолирован вместе с тремя другими из соленых внутренних озер и морской солнечной соленой воды в китайской провинции Цзянсу. При сравнении последовательностей генов 16S рРНК и rpoB штаммы KK48, YCN56, SYNS191 и SYNS196 показали высокое сходство с родами Salinibaculum и SYNS196. ''Salinirubellus'' включен.
Основными полярными липидами этих штаммов являются фосфатидная кислота ( '''P'''фосфатидил'''g'''лицерин (PG),
Метиловый эфир фосфатидилглицерина (PGP-Me),
'''P'''фосфатидил'''g'''лицеринсульфат|'''S'''сульфат (ПГС),
сульфатированный маннозилглюкозиловый диэфир (S-ДГД),
Маннозилглюкозилдиэфир (ДГД) и
дисульфатированный маннозилглюкозиловый диэфир (
Значения среднего согласия нуклеотидов (75,3-77,7%), цифровой гибридизации ДНК-ДНК («in silico»: 24,5-25,9%) и среднего согласия генетического кода | кодируемых аминокислот (66,3-73,4%) между этими четырьмя штаммами и упомянутыми видами были значительно ниже порогового значения для классификации в один и тот же вид (биология). (Виды) – аргумент для отнесения их к собственному новому виду в соответствующем роде.
На основании фенотипических, хемотаксономических, филогенетических и филогеномных характеристик штаммы были классифицированы как эталонные штаммы на четыре новых вида указанных родов, а именно Salinibaculum rarum (KK48), Salinibaculum salinum (YCN56), Salinibaculum marinum (SYNS191) и Salinirubellus. литореус» (SYNS196).
== Систематика ==
Принятая в настоящее время таксономия основана на
Род (Биология)|Род '''''Salinirubellus''''' * Виды (Биология)|Виды '''''Salinirubellus salinus''''' ** Штамм CGMCC 1.12551, также известный как JCM 30036 или ZS-35-S2(L,N)
* Вид Salinirubelluslitoreus ** Штамм SYNS196 псевдоним CGMCC 1.62608 или JCM 36495(L,N,G) - эталонный штамм по данным NCBI
** Штамм 02_S197.semibin_refined.029(N,G) – эталонный штамм согласно GTDB
* Вид Salinirubellus sp036625905(G). ** Штамм NA-0cm_bin.2(N,G)
** Штамм NA-5cm_bin.10(N,G)
** Ствол NA-30cm_bin.5(N,G)
* Вид Salinirubellus sp041642135(G). ** Корень 01_S196.semibin_refined.186(N,G)
----
* Л – * N – Таксономия * Г – Если не указано иное, первый штамм (или первый контиг#MAGs|MAG) является типовым штаммом (
== Происхождение имени ==
Название рода ''Salinirubellus'' составлено из
* Видовой эпитет salinus является новым.
* Видовой эпитет «литореус»
LPSN: [https://lpsn.dsmz.de/genus/salinirubellus Род ''Salinirubellus''] Hou ''et al.'' 2018, Немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур (DSMZ). Кроме того:
* BacDive|Bac''Dive'': [http://bacdive.dsmz.de/index.php?search ... mit=Search ''Salinirubellus''], Немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур (DSMZ).
Национальный центр биотехнологической информации | NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/B ... 2630&lvl=3 Salinirubellus], подробности: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/B ... id=2162630 ''Salinirubellus'' Хоу и др. 2018] (род); графически: [https://lifemap.cnrs.fr/tree?tool=searc ... -mode=true ''Salinirubellus''], на Lifemap.
Цзин Хоу, Ян-Цзе Чжао, Линь Чжу, Хэн-Лин Цуй: ''''Salinirubellus salinus'' gen. ноябрь, сп. nov., выделенный из морской солнечной соленой печи». В: «Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии», том 68, № 6, 9. Апрель 2018 г., С. 1874–1878 гг.;
Лин-Жуй Чжу, Я-Лин Мао, Яо Ху, Я-Пин Сунь, Цзин Хоу, Хэн-Лин Цуй: «Геномная таксономия семейства Haloarculaceae, предложение семейства Natronomonadaceae». ноябрь, и описание четырех новых галофильных архей из двух соленых озер и морской солнечной солеварни».
Категория:Эвриархеоты
Подробнее: https://de.wikipedia.org/wiki/Salinirubellus
'''''Salinirubellus''''' — род (биология)|род галофильных (солелюбивых) архей.
Его типовым видом является '''''Salinirubellus salinus''''',, который со своим эталонным штаммом В 2025 году был впервые описан второй вид этого рода — Salinirubelluslitoreus. Ваш эталонный штамм — SYNS196.
== Описание ==
== ''Salinirubellus salinus'' ==
Эталонный штамм присутствует в первом описании типового вида Salinirubellus salinus от 2018 года.
Основные полярные липиды типа '''P'''фосфатидил'''g'''лицеролфосфат|'''p'''фосфатидиловый эфир|'''Me'''этиловый эфир (PGP-Me),
и три неопознанных гликолипида;
В 2018 году было обнаружено, что два наиболее важных гликолипида хроматографически идентичны сульфатированному и несульфатированному маннозилглюкозиловому диэфиру (S-DGD-1 и DGD-1 соответственно).
Содержание ДНК G+C штамма Филогенетический анализ, основанный на генах 16S рРНК и rpoB (последний генетический код | кодирующий β-часть РНК-полимеразы), показал в 2018 году, что это триба отличается от родственных родов Halomarina, Natronomonas, Halorientalis, Salinirubrum и Halobaculum отряда. Галобактериалы.
В целом фенотипические, хемотаксономические и филогенетические характеристики позволяют предположить, что штамм
== ''Salinirubelluslitoreus'' ==
Эталонный штамм SYNS196 второго вида, опубликованный в 2025 году, Salinirubelluslitoreus (предварительный GTDB Salinirubellus sp037335815 с другим эталонным штаммом) был изолирован вместе с тремя другими из соленых внутренних озер и морской солнечной соленой воды в китайской провинции Цзянсу. При сравнении последовательностей генов 16S рРНК и rpoB штаммы KK48, YCN56, SYNS191 и SYNS196 показали высокое сходство с родами Salinibaculum и SYNS196. ''Salinirubellus'' включен.
Основными полярными липидами этих штаммов являются фосфатидная кислота ( '''P'''фосфатидил'''g'''лицерин (PG),
Метиловый эфир фосфатидилглицерина (PGP-Me),
'''P'''фосфатидил'''g'''лицеринсульфат|'''S'''сульфат (ПГС),
сульфатированный маннозилглюкозиловый диэфир (S-ДГД),
Маннозилглюкозилдиэфир (ДГД) и
дисульфатированный маннозилглюкозиловый диэфир (
Значения среднего согласия нуклеотидов (75,3-77,7%), цифровой гибридизации ДНК-ДНК («in silico»: 24,5-25,9%) и среднего согласия генетического кода | кодируемых аминокислот (66,3-73,4%) между этими четырьмя штаммами и упомянутыми видами были значительно ниже порогового значения для классификации в один и тот же вид (биология). (Виды) – аргумент для отнесения их к собственному новому виду в соответствующем роде.
На основании фенотипических, хемотаксономических, филогенетических и филогеномных характеристик штаммы были классифицированы как эталонные штаммы на четыре новых вида указанных родов, а именно Salinibaculum rarum (KK48), Salinibaculum salinum (YCN56), Salinibaculum marinum (SYNS191) и Salinirubellus. литореус» (SYNS196).
== Систематика ==
Принятая в настоящее время таксономия основана на
Род (Биология)|Род '''''Salinirubellus''''' * Виды (Биология)|Виды '''''Salinirubellus salinus''''' ** Штамм CGMCC 1.12551, также известный как JCM 30036 или ZS-35-S2(L,N)
* Вид Salinirubelluslitoreus ** Штамм SYNS196 псевдоним CGMCC 1.62608 или JCM 36495(L,N,G) - эталонный штамм по данным NCBI
** Штамм 02_S197.semibin_refined.029(N,G) – эталонный штамм согласно GTDB
* Вид Salinirubellus sp036625905(G). ** Штамм NA-0cm_bin.2(N,G)
** Штамм NA-5cm_bin.10(N,G)
** Ствол NA-30cm_bin.5(N,G)
* Вид Salinirubellus sp041642135(G). ** Корень 01_S196.semibin_refined.186(N,G)
----
* Л – * N – Таксономия * Г – Если не указано иное, первый штамм (или первый контиг#MAGs|MAG) является типовым штаммом (
== Происхождение имени ==
Название рода ''Salinirubellus'' составлено из
* Видовой эпитет salinus является новым.
* Видовой эпитет «литореус»
LPSN: [https://lpsn.dsmz.de/genus/salinirubellus Род ''Salinirubellus''] Hou ''et al.'' 2018, Немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур (DSMZ). Кроме того:
* BacDive|Bac''Dive'': [http://bacdive.dsmz.de/index.php?search ... mit=Search ''Salinirubellus''], Немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур (DSMZ).
Национальный центр биотехнологической информации | NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/B ... 2630&lvl=3 Salinirubellus], подробности: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/B ... id=2162630 ''Salinirubellus'' Хоу и др. 2018] (род); графически: [https://lifemap.cnrs.fr/tree?tool=searc ... -mode=true ''Salinirubellus''], на Lifemap.
Цзин Хоу, Ян-Цзе Чжао, Линь Чжу, Хэн-Лин Цуй: ''''Salinirubellus salinus'' gen. ноябрь, сп. nov., выделенный из морской солнечной соленой печи». В: «Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии», том 68, № 6, 9. Апрель 2018 г., С. 1874–1878 гг.;
Лин-Жуй Чжу, Я-Лин Мао, Яо Ху, Я-Пин Сунь, Цзин Хоу, Хэн-Лин Цуй: «Геномная таксономия семейства Haloarculaceae, предложение семейства Natronomonadaceae». ноябрь, и описание четырех новых галофильных архей из двух соленых озер и морской солнечной солеварни».
Категория:Эвриархеоты
Подробнее: https://de.wikipedia.org/wiki/Salinirubellus