НБПФ8 ⇐ Васина Википедия

[wiki_en]

= НБПФ8 =
Член 8-го семейства точек разрыва нейробластомы (NBPF8) представляет собой белок, который у человека разумного (человека) кодируется геном NBPF8.

=== Джин ===
NBPF8 является членом семейства точек разрыва нейробластомы (NBPF) и расположен на плюсовой цепи хромосомы 1 человека в месте 1p11.2
=== мРНК ===

=== Белок ===
Белок NBPF8, кодируемый вариантом 1 транскрипта NBPF8, содержит 942 аминокислоты, имеет молекулярную массу 10,9 кДа и изоэлектрическую точку, равную 4,7
==== Композиционный анализ ====
Белок NBPF8 у человека разумного содержит больше глутаминовой кислоты и глютамина (аминокислот), чем средний белок, но при этом содержит меньше треонина, чем типичный белок

==== Внутренние структуры/домены/мотивы ====
Семейство NBPF идентифицируется с помощью повторяющихся копий белковых доменов DUF1220, также известных как домен Olduvai|домены Olduvai. Последовательности, кодирующие эти белковые домены, демонстрируют наибольшее увеличение числа копий, специфичных для человеческой линии, среди всех кодирующих областей генома
==== Субклеточная локализация ====
Предполагается, что NBPF8 находится внутриклеточно с вероятностью 0,9748
==== Белковые взаимодействия ====
Таблица 1. Взаимодействия с белками * NIMA (никогда не участвующий в митозе ген А), родственная киназа 4 * Этот белок представляет собой серин/треониновую протеинкиназу, необходимую для регулярного вступления клетки в процесс репликативного старения, и участвует в остановке клеточного цикла
* Что касается клинического применения, высокая экспрессия NEK4 коррелирует с колоректальным раком и раком легких. Кроме того, было проведено исследование, изучающее NEK4 как потенциальную мишень для лечения шизофрении и биполярного расстройства I типа.
* Каллин 4Б * Этот белок образует комплекс, который действует как убиквитинлигаза и катализирует полиубиквитинирование специфических белковых субстратов в клетке.
* Что касается клинического применения, было обнаружено, что CUL4B стимулирует пролиферацию и одновременно ингибирует апоптоз клеток остеосаркомы у людей.
* Рецептор эпидермального фактора роста * Этот белок представляет собой трансмембранный гликопротеин, входящий в семейство протеинкиназ. Действие этого белка, вызывающее димеризацию рецепторов и аутофосфорилирование тирозина, приводит к пролиферации клеток.
* Что касается клинического применения, мутации связаны с раком легких.
* Убиквитин C * Убиквитинирование связано с деградацией белка, регуляцией клеточного цикла, репарацией ДНК, модификацией киназы, эндоцитозом и регуляцией других клеточных сигнальных путей.

=== Экспрессия и состояния заболевания ===

==== Общее выражение ====
Существует умеренная и повсеместная экспрессия NBPF8 в тканях организма.

==== Состояния заболевания ====
Таблица 2. Таблица результатов цитоплазматического окрашивания для оценки экспрессии NBPF8 при раке Анализ рисунка 5: Клетки рака молочной железы MCF-7 с подавленным альфа-рецептором эстрогена
У «Homo sapiens» клетки рака молочной железы MCF7 имеют очень высокую экспрессию NBPF8, условно со значениями 5,54, 5,55 и 5,28, в то время как при нокдауне альфа-рецептора эстрогена экспрессия NBPF8 падает до произвольных значений 4,26, 4,36 и 4,21. Хотя эта разница может показаться не радикальной и не важной, в пределах выборки этот процентиль экспрессии падает с 41-49% до 11-14%, что ясно указывает на преобладание NBPF8 в клетках рака молочной железы MCF7. Это важно, поскольку альфа-рецептор эстрогена является фактором транскрипции, который связывается с эстрогеном/эстрадиолом и посылает сигналы, стимулирующие рост рака молочной железы

Анализ рисунка 6: Болезнь Альцгеймера: Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки | Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки с мутацией пресенилина-2 (N141)
У «Homo sapiens» в индуцированных плюрипотентных стволовых клетках (ИПСК), которые не подвергались экспериментальному манипулированию, экспрессия NBPF8 относительно ниже, чем в обоих следующих условиях: когда ИПСК происходят из соматических клеток больных спорадической болезнью Паркинсона и ИПСК с наличием мутации пресенилина 2 (PS2). В контрольной группе экспрессия NBPF8 имела произвольное значение 9,46 при 23%, исследование, проведенное на ИПСК, полученных из соматических клеток больных спорадической болезнью Паркинсона (ненаследственная болезнь Паркинсона), имело произвольное значение 7,87 с рангом 22%, и, наконец, в ИПСК с мутацией PS2 экспрессия NBPF8 имела произвольные значения 18,87 и 15,48, с рангами 41% и 40% соответственно. Эти данные говорят о том, что конкретной исследованной мутацией PS2 была N141; Было обнаружено, что N141I, мутация поволжских немцев, связана с болезнью Альцгеймера из-за изменения метаболизма белка бета-амилоида и белка-предшественника бета-амилоида человека.
=== Эволюция ===

==== Паралоги ====
Ген NBPF8 является частью семейства генов, семейства точек разрыва нейробластомы (всего 22 гена), и поэтому имеет множество паралогов внутри этого семейства. Помимо генов в семействе точек разрыва нейробластомы и исключая неохарактеризованные белки, существует только один паралог, связанный с NBPF8, который представляет собой миомегалин; Изоформа 16 миомегалина имеет самый высокий процент идентичности - 32,94%. Примечательно то, что миомегалин имеет ортологи у акул и скатов (костистых рыб), которые эволюционно простираются дальше, чем ортологи NBPF8; Обратите внимание, что семейство точек останова нейробластомы в целом не простирается дальше эволюционно, чем NBPF8 в отдельности.

Таблица 3. Паралоги NBPF8

==== Ортологи ====
У приматов существуют только прямые ортологи NBPF8, что согласуется с остальными генами в семействе точек разрыва нейробластомы; С эволюционной точки зрения, наиболее далеким от человека видом («Homo sapiens»), у которого обнаружены эти ортологи NBPF8, является «Aotus nancymaae» (ночная обезьяна Ма). Этот белок имеет дату отклонения от человеческого происхождения 43 миллиона лет, поэтому он является самым дальним ортологом NBPF8 более чем на 34 миллиона лет. Ниже будет показано, что представляет собой каждый из ортологов и что представляет собой его трехбуквенный код, за которым следует «_NBPF8», поскольку эти коды будут использоваться для более краткого описания того, какая белковая последовательность является какой:

* Hsa_NBPF8: белок NBPF8, обнаруженный у Homo sapiens|''Homo sapiens'' (Человек)
* Ppa_NBPF8: белок NBPF8, обнаруженный у Pan paniscus (карликовый шимпанзе)
* Ggo_NBPF8: белок NBPF8, обнаруженный у гориллы-гориллы | ''Горилла-горилла-горилла'' (западная равнинная горилла)
* Ana_NBPF8: белок NBPF8, обнаруженный у Aotus nancymaae|''Aotus nancymaae'' (ночная обезьяна Ма)

Таблица 4. Ортологи NBPF8


Подробнее: https://en.wikipedia.org/wiki/NBPF8