Томас А. Дарден ⇐ Васина Википедия

[wiki_en]

Томас Эпплтон Дарден (родился 2 декабря 1948 г.) — американский выдающийся математический статистик и биофизик, известный своим вкладом в вычислительную химию и молекулярную динамику. Он наиболее известен как соавтор метода сетки частиц Эвальда (PME), быстрого алгоритма для расчета электростатических взаимодействий на больших расстояниях в молекулярном моделировании, который стал краеугольным камнем современного программного обеспечения для молекулярной динамики, такого как AMBER, CHARMM и GROMACS. Его индекс Хирша превышает 77, а его публикации цитируются более 100 000 раз.
==Молодость и образование==
Дарден родился в Денвере, штат Колорадо, 2 декабря 1948 года. Он получил степень бакалавра наук по математике в Университете Нью-Мексико в 1970 году, а затем степень магистра наук по математике в Чикагском университете в 1971 году.Калифорнийский университет - Библиотека Беркли, диссертации (1978), Томас А. Дарден. Он защитил докторскую диссертацию. получил степень доктора статистики в Калифорнийском университете в Беркли в 1978 году. Его диссертация под руководством Ежи Неймана под названием «Приближение псевдостационарного состояния для стохастической кинетики ферментов» исследовала стохастические модели кинетики ферментов.
==Карьера==
После получения докторской степени и преподавания в Университете Мэриленда, Колледж-Парка и Университете Висконсин-Мэдисон Дарден в 1981 году присоединился к Национальному институту наук о здоровье окружающей среды (NIEHS) в качестве научного сотрудника, а позже стал математическим статистиком. Его исследования в NIEHS были сосредоточены на применении молекулярного моделирования и вычислительных методов для решения проблем здоровья человека, включая исследования белков, нуклеиновых кислот | нуклеиновых кислот и лигандов рецепторов.
В 2008 году он присоединился к OpenEye, ныне Cadence, в Санта-Фе, штат Нью-Мексико.
==Исследования и влияние==

В начале 1990-х годов Дарден тесно сотрудничал с химиком Ли Г. Педерсеном из Университета Северной Каролины в Чапел-Хилл и Даррином М. Йорком, тогдашним аспирантом Педерсена, для решения давней вычислительной проблемы в молекулярной динамике: как точно и эффективно рассматривать электростатику. Новый алгоритм, известный как метод сетки частиц Эвальда (PME), представил подход, основанный на быстром преобразовании Фурье (БПФ), который значительно улучшил скорость и точность суммирования Эвальда, используемого при моделировании электростатических взаимодействий на больших расстояниях.
Первая статья PME, опубликованная в 1993 году в «Журнале химической физики», представила масштабируемый метод N·log(N) для больших систем, за которым последовал усовершенствованный «гладкий алгоритм PME» в 1995 году. Вместе эти работы произвели революцию в методах молекулярного моделирования и стали основой для таких программных пакетов, как AMBER, CHARMM, NAMD и GROMACS. По состоянию на 2025 год две статьи PME были процитированы более 50 000 раз в Google Scholar, что сделало их одними из самых влиятельных публикаций в области вычислительной химии.
Помимо PME, Дарден внес вклад в разработку численных методов анализа траекторий молекулярной динамики, эффективных алгоритмов электростатических расчетов и графических методов молекулярного представления. Его совместная работа распространилась на структурное моделирование белков, таких как протеаза ВИЧ-1.
Он является автором или соавтором более 240 научных статей, многие из которых опубликованы в таких журналах, как «Журнал химической физики», «Биохимия (журнал) | Биохимия», «Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки | Труды Национальной академии наук» и «Структурная биология природы».
==Награды и почести==
* Фи Бета Каппа, Университет Нью-Мексико (1970 г.)
* Стипендия выпускников Национального научного фонда, Чикагский университет (1970–1972 гг.)
* Премия Мемориала Эвелин Фикс за диссертацию, Калифорнийский университет, Беркли (1978 г.)
* Премия NIEHS за научные заслуги (1995, 1998 гг.)

==Избранные публикации==
* * *

1948 года рождения
Люди из Денвера, Колорадо
Выпускники Университета Нью-Мексико
Выпускники Чикагского университета
Выпускники Калифорнийского университета в Беркли
Американские статистики
Американские биофизики
Американские компьютерные химики
Американские биоинформатики
Химики-теоретики
Молекулярная динамика

Подробнее: https://en.wikipedia.org/wiki/Thomas_A._Darden