Мобильная версия'''''Methanoculleus''''' — род (биология)|род архей внутри семейства (биология)|семейства Methanomicrobiaceae|Methanomicrobiaceae в типе Methanobacteriota (ранее называвшемся «Euryarchaeota»).
Виды (биология)|Виды рода ''Methanoculleus'' обитают в солоноватой воде|солоноватоводно-морской среде и очень распространены в биореакторах, на свалках и в сточных водах. В отличие от других архей, Methanoculleus и некоторые виды родственных родов могут использовать этанол и некоторые вторичные спирты в качестве доноров электронов для производства метана. Это оказывает влияние на глобальный баланс производства метана; а поскольку метан является мощным парниковым газом, он также имеет последствия для глобального изменения климата.
== ''Methanoculleus bourgensis'' ==
''Methanoculleus bourgensis'' является типовым видом рода ''Methanoculleus'', эталонный штамм - ATCC 43281, псевдоним DSM 3045, MS2 или OGC 15.
Некоторые штаммы этого вида ранее считались эталонными штаммами отдельных видов Methanoculleus, но в 2003 году они были синонимизированы.
Штамм E02.3 паразитирует литическим вирусом Methanoculleus|вирусом Blf4 (вид: Flagovirus limi, семейство Pungoviridae, класс Caudoviricetes, морфотип: Siphoviruses).
Как показала электронная микроскопия, Blf4 связывается как с вегетативными клетками «M. bourgensis» E02.3, так и с их клеточными придатками (предположительно жгутик#архея|архаелла). Тесты с рядом других штаммов Methanoculleus показали, что все они не лизируются Blf4, что указывает на узкий круг хозяев для этого бактериофага.
Штамм MAB1 был идентифицирован как гидрогенотрофный (утилизирующий водород) партнер мезофильных ацетатокисляющих бактерий, синтрофия, которая имеет важное значение во многих биогазовых процессах. Геном этого штамма имеет общий размер 2 859 299 пар оснований и, по прогнозам, содержит 3 450 генов, кодирующих белково-генетический код, из которых только 1 472 (43%) могут быть присвоены известные функции в 2016 году. Геном также содержит 44 гена тРНК и три гена рРНК (один 5S, один 16S и один 23S рРНК). Синтрофное взаимодействие близко к термодинамическому равновесию | термодинамическому равновесию: синтрофное окисление ацетата (САО) высвобождает лишь очень небольшое количество энергии, которую должны разделить оба партнера. Этого достаточно, чтобы обеспечить рост микроорганизмов. Двухстадийная реакция начинается с окисления ацетата до диоксида углерода (CO2) и водорода/формиата так называемыми синтрофными бактериями, окисляющими ацетат (
В общей сложности четыре метаногенных штамма были выделены из богатых аммиаком мезофильных биогазовых процессов, обозначенных MAB1, MAB2, MAB3 и BA1 и филогенетически родственных «M. bourgensis'' принадлежат. Среди них, помимо MAB1, BA1 также оказался подходящим метаногенным партнером для мезофильных SAOB
* ''Schnuerera|Schnuerera ultunensis'' (ранее назывался ''Clostridium|Clostridium ultunense''; семейство Tissierellaceae, класс Clostridia),LPSN: [https://lpsn.dsmz.de/species/schnuerera-ultunensis Виды ''Schnuerera ultunensis''].
* ''Tepidanaerobacter|Tepidanaerobacter acetatoxydans'' (семейство Tepidanaerobacteraceatoxydans, также класс Clostridia),LPSN: [https://lpsn.dsmz.de/species/tepidanaer ... tatoxydans Виды ''Tepidanaerobacter acetatoxydans''. и
* ''Syntropaceticus|Syntropaceticus schinkii'' (семейство Thermacetogeniaceae, класс Syntropomonadia).LPSN: [https://lpsn.dsmz.de/species/syntropaceticus-schinkii Виды ''Syntropaceticus schinkii''.
(все относятся к типу Bacillota).
== ''Methanoculleus submarinus'' ==
Эталонный штамм Nankai-1 Methanoculleus submarinus представляет собой анаэробный мезофильный метаногенный архей, выделенный из глубоководных отложений, содержащих гидрат метана (250 метров ниже морского дна). Он неподвижен (не мобилен) и имеет крайне неправильную кокковидную (округлую) форму со средним диаметром 0,8–2,0 метра#мкм|мкм).
Клетки растут с использованием водорода или формиата в качестве субстрата (экология) | катаболического субстрата, им нужен ацетат в качестве источника углерода. Хотя дрожжевой экстракт и пептоны не обязательны, они увеличивают скорость роста. Клетки растут быстрее всего при 45°C; рост невозможен за пределами диапазона от 10°C до 55°C.
Оптимальное значение pH | диапазон pH составляет от 5,0 до 8,7; рост невозможен за пределами диапазона от 4,7 до 9,0. Рост происходит в широком диапазоне солености от 0,1 до 1,5 молярной концентрации #Моляр|ᴍ (моль/литр|ℓ) Na+ (катионы натрия).
== Список видов ==
Принятая в настоящее время таксономия основана на По состоянию: 24 октября 2025 г.
Род (Биология)|Род '''''Methanoculleus'''''
* Виды (Биология)|Виды “''Candidatus (Биология)|Candidatus'' Methanoculleus ammoniitolerans” ** Штамм MAG17
* Вид '''''Methanoculleus bourgensis''''' corrig. ( ** Штамм OGC 15(L,N), он же ATCC 43281, он же DSM 3045 или MS2(L,N)
** Штамм RC/ER – ссылка на «M. олентанги''
** Штамм CB-1, также известный как DSM 6216 – ссылка на «M. oldenburgensis''
** Штамм E02.3
** Штаммы MAB1; MAB2; МАБ3; BA1
* Вид Methanoculleus Caldifontis ** Штамм BCRC AR10059, также известный как NBRC 114596 или Wushi-06(L,N)
* Вид Methanoculleus chikugoensis ** Штамм DSM 13459, также известный как JCM 10825, NBRC 101202(L,N) или MG62(L,N)
* Вид «Methanoculleus formosensis» ** Штамм Afa-1, также известный как BCRC AR10054 или NBRC 113995(L,N)
* Вид ''Methanoculleus frigidifontis'' ** Штамм BCRC AR10056, также известный как FWC-SCC1, NBRC 113993(L,N) или SCC 1(L)
* Вид «Methanoculleus horonobensis» ** Штамм DSM 21626, также известный как JCM 15517 или T10(L,N)
* Вид «Methanoculleus Hydrogenitropicus» ** Штамм CGMCC 1.5146, также известный как DSM 25996, HC или JCM 16311(L,N)
* Вид ''Methanoculleus marisnigri'' ( ** Штамм ATCC 35101, также известный как DSM 1498, JR1, OCM 56(L,N) или OCG:56(N)
* Вид «Methanoculleus methanifontis» ** Штамм BCRC AR10057, также известный как FWC-SCC3, NBRC 113994(L,N) или SCC 3(L)
* Вид Methanoculleus nereidis ** Штамм BCRC AR10060, также известный как NBRC 114597 или YWC-01(L,N)
* Вид Methanoculleus Oceani ** Штамм BCRC AR10055, также известный как CWC-02 или NBRC 113992(L,N)
* Вид Methanoculleus palmolei ** Штамм DSM 4273, также известный как INSLUZ(L,N)
* Вид «Methanoculleus receptaculi» ** Штамм CGMCC 1.5087, также известный как DSM 18860 или ZC-2(L,N)
** Штамм ZC-2(N)
* Вид Methanoculleus sediminis ** Штамм DSM 29354, также известный как S3Fa(L,N) или BCRC AR10044(L)
* Вид Methanoculleus submarinus ** Штамм DSM 15122, также известный как Nankai-1, OCM 780 или SMCC 780W(L,N)
* Вид Methanoculleus taiwanensis ** Штамм CYW4, также известный как NBRC 110782(L,N) или BCRC AR10043(N)
* Вид «''Candidatus'' Methanoculleus thermo Hydrogenitropicus» исправ. ** Штамм DTU006(L)
* Вид ''Methanoculleus thermophilus'' corrig. ** Штамм ATCC 33837, также известный как CR-1, DSM 2373 или OCM 174(L,N)
** Штамм FR-4, известный как DSM:2832(N) (ссылка на «M. frittonii»)
* Вид Methanoculleus sp. 10(Н)
* Вид Methanoculleus sp. 12X3c12(N)
* Вид Methanoculleus sp. 1H2c2(N)
* Вид Methanoculleus sp. 20(Н)
* Вид Methanoculleus sp. 22(Н)
* Вид Methanoculleus sp. 25XMc2(N)
* Вид Methanoculleus sp. 7Т(Н)
* Вид Methanoculleus sp. Анну2(N)
* Вид Methanoculleus sp. Анну3(N)
* Вид Methanoculleus sp. Анну6(N)
* Вид Methanoculleus sp. Анну7(N)
* Вид Methanoculleus sp. Анну8(N)
* Вид Methanoculleus sp. BA1(N)
* Вид Methanoculleus sp. CAG:1088(N)
* Вид Methanoculleus sp. DTU007(N)
* Вид Methanoculleus sp. EBM-46(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. F27(Н)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. HC-1(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. IIE1(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. ЛЕВ(Н)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. LH2(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. M06(Н)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. M07(Н)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. M11(Н)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. MAB1(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. МАБ2(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. MAB3(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. MCMB-578(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. MCMB-579(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. MCMB-580(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. MCMB-889(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. MH98A(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. MQ-4(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. РПС4(Н)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. СДБ(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. SLH121(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. T02(Н)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. T03(Н)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. T05(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. T14(Н)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. T6-6.21(Н)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. T6-6.68(Н)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. T6-7.27(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. T6-7.90(Н)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. T6-8.48(Н)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. T6-8.7(Н)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA208(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA291(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA300(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA303(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA307(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA312(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA320(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA326(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA331(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA334(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA340(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA374(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA377(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA389(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA406(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA413(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA416(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA430(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA45(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. UBA77(N)
* Виды ''Methanoculleus'' sp. дм2(N)
----
----
Л) – :(N) – Таксономия Der erstgenannte Stamm — это жемчужина Referenzstamm.В дер
== Филогения ==
|1=''М. тайваньский''
|label2= |2= |1=''М. сосуды''
|label2= |2= |1=''М. пальмолеи''
|label2= |2= |1='''''М. бургенсис'''''
|label2= |2= |label1= |1= |1=''М. седиминис''
|label2= |2= |1=''M. гидрогенитрофикус''
|2=''М. термофилус''
|label2= |2= |1=''М. хоронобенсис''
|label2= |2= |1=''М. чикугоенсис''
|label2= |2= |1=''М. Мариснигри''
|2=''М. субмаринус''
|1=''М. тайваньский''
|label2= |2= |label1= |1= |1=''М. термофилус''
|label2= |2= |1='''''М. бургенсис'''''
|2=„''Ca.'' M. thermo Hydrogenotropicus“
|label2= |2= |1=''М. чикугоенсис''
|label2= |2= |1=''М. хоронобенсис''
|label2= |2= |1=''М. седиминис''
|2=''М. мариснигри''
Виды ''incertae sedis'':
* «''Ca.'' M. ammoniitolerans»
== Этимология ==
Der Gattungsname ''Methanoculleus'' leitet sich ab von neu
* [https://microbewiki.kenyon.edu/index.ph ... leus&go=Go Search: Methanoculleus. MicrobeWiki, Кеньон-Колледж, факультет биологии.
== Weiterführende Literatur ==
*
LPSN: [https://lpsn.dsmz.de/genus/methanoculleus Род ''Methanoculleus''] Maestrojuán ''et al.'' 1990.
BacDive|Bac''Dive'': [https://bacdive.dsmz.de/strain/7030 ''Methanoculleus submarinus'' Nankai-1]. DSM 15122, OCM 780, SMCC 780 Вт.
Национальный центр биотехнологической информации | Браузер таксономии NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/B ... e&id=45989 Methanoculleus]. Подробности. [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/B ... e&id=45989 ''Methanoculleus'' Maestrojun et al. 1990]. Ранг: род. График: [https://lifemap.cnrs.fr/tree?efficiency ... &tid=45989 ''Methanoculleus''], а также: Lifemap.
GTDB: [https://gtdb.ecogenomic.org/tree?r=g__Methanoculleus https://gtdb.ecogenomic.org/tree?r=g__Methanoculleus], [https://gtdb.ecogenomic.org/tree?r=g__Methanoculleus_A ''Methanoculleus_A''].
База данных таксономии генома (GTDB), выпуск 09-RS220:
* * *
Проект «Всевидовое живое дерево» (LTP_06_2022):
* * *
Международный комитет по таксономии вирусов, das Internation|ICTV: [https://ictv.global/taxonomy/taxondetai ... rus%20limi Название таксона: ''Flagovirus limi'']. [https://ictv.global/sites/default/files ... 51013.xlsx VMR_MSL40.v2.20251013.xlsx].
Сусуму Асакава, Казунари Нагаока: «Methanoculleus bourgensis», «Methanoculleus olentangyi» и «Methanoculleus oldenburgensis» являются субъективными синонимами». В: «Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии», Band 53, Nr. 5; 1. сентября 2003 г.;
Шэн-Чунг Чен, Мэй-Фей Чен, Мэй-Чин Лай, Чие-Инь Венг, Сью-Яо Ву, Солвуд Лин, Цаньяо Ф. Ян, По-Чун Чен: ''''Methanoculleus sediminis'' sp. nov., метаноген из отложений вблизи подводного грязевого вулкана». В: «Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии», Band 65, Nr. 7; 1 июля 2015 г.;
Шу-Юнг Лай, Мэй-Чин Лай, Саулвуд Линь, И-Тин Ю, Вэнь-Синь Вэй, Ю-Вэй Чен, Цзих-Хань Лань, Цзя-Сю Фань, Сью-Яо Ву, Чуан-Чуань Хун, Цзюнь-Янь Дин, Вэй-Лин Чжан, Ю-Чен Дэн, Ю-Чиен Ли, Чао-Джень Ши, Йен-Чи Ву, Цзинцзин Чжао, Инь Ли, Шэн-Чунг Чен: «Шесть новых видов рода Methanoculleus, выделенных из различных сред Тайваня». В: «Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии», Band 74, Nr. 7, июль 2024 г.;
Глория М. Маэстрохуан, Дэвид Р. Бун, Луйинг Сюнь, Роберт А. Мах, Ланьфан Чжан: «Перенос «Methanogenium bourgense», «Methanogenium marisnigri», «Methanogenium olentangyi» и «Methanogenium thermophilicum» в род «Methanoculleus» gen. ноябрь, поправки к «Methanoculleus marisnigri» и «Methanogenium», а также описание новых штаммов «Methanoculleus bourgense» и «Methanoculleus marisnigri». В: «Международный журнал систематической бактериологии», Band 40, Nr. 2, 1 апреля 1990 г., С.117–122;
Шахид Манзур, Анна Шнурер, Эрик Бонгкам-Рудлофф, Беттина Мюллер: «Полная последовательность генома штамма MAB1 Methanoculleus bourgensis, синтрофного партнера мезофильных ацетат-окисляющих бактерий (SAOB).» В: «BMC»: «Экологический микробиом»: «Стандарты в геномных науках», Band 11, № 1, 12. Октябрь 2016 г.,
Джилл А. Микаки, Итай Лю, Марк Делвич, Фредерик С. Колвелл, Дэвид Р. Бун: «Выделение метаногена из глубоководных морских отложений, содержащих гидраты метана, и описание Metanoculleus submarinus sp. ноябрь.» В: «Прикладная и экологическая микробиология», Группа 69, № 6, 1 июня 2003 г.,
А. Нойбек, Н. Каллак, С. Исакссон, А. Шнурер: «Рост гидрогенотрофного метаногена Methanoculleus bourgensis MAB1 в присутствии дунита». В: «Анаэроб», Band 92, апрель 2025 г., S. 102945;
Бернар М. Оливье, Роберт А. Ма, Жан-Луи Гарсия, Дэвид Р. Бун: «Выделение и характеристика Methanogenium bourgense» sp. ноябрь.» В: «Международный журнал систематической бактериологии», группа 36, № 2, апрель 1986 г., S. 297-301;
Цзяньцин Тянь, Яньфэнь Ван, Сючжу Донг: ''Methanoculleus Hydrogenitropicus'' sp. nov., метаногенный архей, выделенный из почвы водно-болотных угодий». В: «Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии», Band 60, Nr. 9, 1. Сентябрь 2010 г., S. 2165–2169;
Катрин Вайденбах, Сандро Вольф, Энн Купчок, Тобиас Керн, Мартин А. Фишер, Йохен Ритц, Наталья Урбанска, Свен Кюнцель, Рут А. Шмитц, Михаэль Ротер; «Характеристика Blf4, архейного литического вируса, нацеленного на представителя Methanomirobiales». В: «MDPI»: «Вирусы», Группа 13, № 10, 26 сентября 2021 г., С. 1934 г.;
Нильс Венг, Абхиджит Сингх, Йонас А. Олссон, Ян Дольфинг, Мария Вестерхольм: «Катаболизм и взаимодействие синтрофных микроорганизмов, окисляющих пропионат и ацетат, в мезофильных условиях с высоким содержанием аммиака». В: «Frontiers Microbiology», Band 15, Nr. 1389257, 5 июня 2024 г.;
Категория:Эвриархеоты
Подробнее: https://de.wikipedia.org/wiki/Methanoculleus