Вирусный эпитрансциптом ⇐ Васина Википедия

[wiki_en]

«Вирусный эпитранскриптом» включает все модификации вирусных транскриптов, изученные с помощью «вирусной эпитранскриптомики». Как и более общий эпитранскриптом, эти модификации не влияют на последовательность транскрипта, а скорее имеют последствия для последующих структур и функций.

== История ==
Открытие модификаций мРНК относится к 1957 году, когда была открыта модификация псевдоуридина.
== Механизмы ==

=== Комплексы ===
Модификации вирусной РНК используют тот же механизм, что и клеточная РНК. Это предполагает использование комплексов «писатель» и «читатель». Комплекс «писатель» содержит фермент, подобный метилтрансферазе 3 (METTL3), и его кофакторы, такие как METTL14, WTP, KIAA1492 и RBM15/RBM15B, которые добавляют m6Модификация в ядре. Семейство белков, известных как YTH, таких как YTHDC1 и YTHDC2, способно обнаруживать эти модификации внутри ядра.
=== N6-Метиладенозин (m6А) ===
Эта модификация включает добавление метильной группы (-CH3) к 6-му атому азота аденинового основания в молекуле мРНК. Это была одна из первых модификаций мРНК, обнаруженных в 1974 году.
Большинство РНК-вирусов выполняют свои циклы в цитоплазме, вдали от необходимых механизмов для записи и стирания модификаций m6A, которые находятся в ядре. Для ДНК-вирусов, которые циклически проходят в ядре с прямым доступом к указанным механизмам, модификациям m6A нельзя приписать четкую общую положительную или отрицательную регуляторную роль. Было показано, что в вирусе обезьян и вирусе гепатита B разные считывающие комплексы m6A играют разную роль в регуляции: некоторые из них имеют консервативную положительную роль, а другие оказывают нейтральное или отрицательное влияние на репликацию.

=== О-метилирование ===
Эта модификация включает добавление метильной группы к 2'-гидроксильной (-ОН) группе рибозного сахара молекул РНК.
У разных вирусов есть свои механизмы приобретения этой модификации. Цитоплазматические РНК-вирусы, такие как флавириды и коронавирусы, кодируют необходимые для катализа реакции образования кепки, при этом некоторым требуется один фермент для 5'-кэпа и 2-O-метилирования, тогда как другим, как поксвирусам, требуются два фермента.
== Иммунная система ==
Модификации вирусной РНК играют важную роль во взаимодействии с иммунной системой клеток-хозяев. Модификация вирусных РНК m6A позволяет вирусам избегать распознавания рецептором гена I, индуцируемым ретиноевой кислотой (RIG-I), в ответе на IFN 1 типа, важнейшем пути врожденного иммунитета. . Кэпирование 5'-N-7-метилгуанизона и 2-O-метилирование также играют жизненно важную роль в развитии вирусных инфекций. Кэп-структуры помогают вирусной РНК сливаться с модифицированной клеточной мРНК и избегать запуска систем иммунного ответа.



Молекулярная биология
Вирусология
Вирусные гены

Подробнее: https://en.wikipedia.org/wiki/Viral_epitransciptome