'''''Койопавирусы'''' являются одними из По состоянию на 8 марта 2024 г. в это семейство входят род (биологический)|род Antichaacvirus и Homochaacvirus.
== Описание ==
===Геном и протеом ===
В состав «Chaacviridae» в настоящее время (по состоянию на 8 марта 2024 г.) входят два рода, которые имеют относительно схожий функциональный состав в своих протеомах, даже если последовательность генома демонстрирует относительно низкую консервативность и, следовательно, сравнительно мало общего, и эти два рода являются также разные имеют генные механизмы. В ходе эволюционной истории вирусов этого семейства, по-видимому, в геноме происходили инверсии (генетика): название рода «Antichaacvirus» относится к инверсии генного модуля, включая ген белкового праймера | праймированная ДНК-полимераза семейства B (pPolB) этого рода.
Хотя члены генетического кода «Homochaacvirus» и «Antichaacvirus»|кодируют близкородственные капсид#капсомеры|основные капсидные белки (MCP), их гены pPolB очень различны и образуют две разные клады на филогенетическом дереве|филогенетическом дереве. дерево .
По сравнению с хорошо описанным DJR-MCP (MCP с
Также были идентифицированы родственники «Chaacviridae» с сильно отличающимися DJR-MCP (предполагаемое семейство «Ixchelviridae»), но среди них до сих пор не было собрано полных геномов, поэтому в настоящее время среди них нет полных геномов. пока не являются подтвержденными представителями ICTV (по состоянию на 2023 год).
Однако полные геномы можно собрать из трех представителей Chaacviridae.
Они показывают инвертированные терминальные повторы ( Эти три вируса имеют среднее совпадение нуклеотидов менее 90% и, следовательно, представляют собой отдельные виды. Род «Homochaacvirus» включает вирусы PBV304 и PBV305, а род «Antichaacvirus» содержит PBV266 в качестве единственного представителя.
«Ixchelviridae» представлены вирусами бассейна Пескадеро PBV176 и PBV180, хотя полнота собранного контига неизвестна.
Даже если членов «Chaacviridae» нельзя было отнести ни к одному из вирусных семейств, известных в 2022 году, они отдаленно похожи на членов класса «Tectiliviricetes», который включает бактериофаги|бактериальные вирусы семейств. «Tectiviridae» и «Corticoviridae», а также архейные вирусы принадлежат к семейству «Turriviridae», поэтому они были отнесены к новому порядку «Coyopavirales» в рамках существующего класса «Tectiliviricetes». .
=== Хосты ===
Предполагается, что Chaacviridae заразят представителей отряда Euryarchaeota Methanophagales (ранее называвшегося ANME-1).
== Систематика ==
Систематика Coyopavirales соответствует
Отряд (биология)|Отряд '''''Coyopavirales'''''
* Семейство (биология)|Семейство '''''Chaacviridae'''''
**Род (биологический)|Род ''Antichaacvirus''
*** Виды (Биология)|Виды «Antichaacvirus pescaderoense»
**** Штамм (биология)#Штаммы вируса|Штамм Methanophagales вируса PBV266
–Местоположение: Метагеном образца окружающей среды, собранного 18 ноября 2018 г. из гидротермального поля южной части бассейна Пескадеро в Калифорнийском заливе (Мексика). )
** Род «Homochaacvirus»
*** Вид Homochaacvirus Californiense
**** Штамм вируса Methanophagales PBV305– Местонахождение: Метагеном образца окружающей среды, собранного 14 ноября 2018 г. из гидротермального поля южной части бассейна Пескадеро в Калифорнийском заливе (Мексика)PBV304: * Семейство «Ixchelviridae» (предлагаемый кандидат)
*::* Штамм вируса бассейна Пескадеро PBV264
– Местонахождение: бассейн Пескадеро
*::* Штамм вируса бассейна Пескадеро PBV238
– Местонахождение: бассейн Пескадеро
== Этимология ==
Название отряда «Койопавирусы» относится к богу грома #mythology|Богу грома богов майя|Мифологии майя по имени Чаак#Другие боги грома|Койопа, окончание «-virales» обозначает вирусные отряды.
* Название семейства Chaacviridae относится к Чааку, богу грома, дождя, грома, плодородия и земледелия, а также смерти в мифологии майя; окончание «-viridae» обозначает семейства вирусов.
** Название рода Antichaacvirus происходит от ** Название рода Homochaacvirus происходит от ** Предлагаемая кандидатская фамилия «Ixchelviridae» названа в честь Икс Чел, богини акушерства и медицины майя в мифологии майя; окончание «-viridae» обозначает семейства вирусов.
== Примечания ==
Рафаэль Ласо-Перес, Фабай Ву, Антуан Кремьер, Даан Р. Спет, Джон С. Мадьяр, Март Крупович, Виктория Дж. Орфан: [https://ictv.global/ictv/proposals/2022 ... es_3no.zip Создайте три новые отряды и 5 новых семейств вирусов, связанных с метанотрофными архей] (zip:docx,xlsx). Предложение 2022.001A от мая 2022 г. [https://ictv.global/filebrowser/download/11756 docx], [https://web.archive.org/web/20230308181 ... r/download /10938 Memento] в веб-архиве от 8 марта 2023 г. (docx).
Международный комитет по таксономии вирусов|ICTV: [https://ictv.global/taxonomy/taxondetai ... opavirales Отряд: ''Coyopavirales'']. Выпуск 2022 г., MSL #38.
Международный комитет по таксономии вирусов|ICTV: [https://ictv.global/taxonomy Taxonomy Browser].
Национальный центр биотехнологической информации | Браузер таксономии NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/B ... e=3&unlock Coyopavirales].
Рафаэль Ласо-Перес, Фабай Ву, Антуан Кремьер, Даан Р. Спет, Джон С. Мадьяр, Кехан Чжао, Март Крупович, Виктория Дж. Орфан: «Эволюционная диверсификация метанотрофных архей ANME-1 и их экспансивного вирома». В: «Природная микробиология», том 8, № 2, 19 января 2023 г., стр. 231–245; doi:10.1038/s41564-022-01297-4, s''f''am Hyper Articles en Ligne|HAL:[https://pasteur.hal.science/pasteur-03976007/document 03976007] (
Категория:Вирусный заказ
Категория:Бактериофаг
Подробнее: https://de.wikipedia.org/wiki/Coyopavirales