Мобильная версияКласс монотипичен в общепринятых систематиках в отряде (биология)|отряд Plagiopylida.
Согласно последним филогенетическим анализам (Graf ''et al.'', 2021), среди Plagiopylea выделяют две клады, т.е. Помимо отряда Plagiopylida (с такими видами, как Plagiopyla frontata и Trimyema compressum), существует вторая группа, связанная с денитрифицирующими бактериальными эндосимбионтами из класса Gammaproteobacteria - к ним относится семейство Epalxellidae с первым Аноксические представители обнаружены в озере Цуг в Швейцарии вместе с облигатным эндосимбионтом Candidatus Azoamicus. реснитчатая.
Таким образом, отряд Odontostomatida, включающий это семейство, представляет вторую кладу (при условии монофилии).
== Plagiopylida — небольшой отряд инфузорий, у представителей которого реснички тела (или реснички) расположены густо и идут от монокинетидВикисловарь: :wikt:en:monokinetid|monokinetid (
Отряд Plagiopylida был введен в 1985 году Юджином Смоллом и Денисом Линном как подкласс Oligohymenophorea. С тех пор их обычно рассматривают как независимый класс; также обсуждалась связь с Colpodea.
== Odontostomatida также относится к небольшому отряду инфузорий. Одноклеточные организмы используют свои (тела) реснички (реснички), в частности, для движения.
Представительным представителем этой группы считается Saprodinium dentatum.
тонкая структура которого была описана в 1908 году Гансом-Гюнтером Шренком и Кристианом Ф. Барделе.
На сегодняшний день характеристика сосредоточена на детальном анализе соматической коры («слоя коры» тела клетки) и оральной реснички (реснички в области устья клетки) этой крайне асимметричной, сжатой с боков инфузории.
Форма клетки определяется серией различных «шипов» в зависимости от местоположения ( SK, состоящие из дикинетид, демонстрируют дифференцировку, которая, по-видимому, характерна и для других одонтостоматид.
Передний сегмент SK преимущественно реснитчатый, за ним следует нереснитчатый сегмент, в котором в кинетосомах отсутствуют все типичные системы волокон.
За исключением SK 4-6, задний сегмент снова реснитчатый и образует кинетосомы шипов, которые соединяются с определенными каудальными шипами («хвостовыми шипами»).
Передний сегмент от SK 3 до SK 7 вместе с двумя лобными кинетиками образует лобную связку и представляет собой основную органоидную структуру, используемую для передвижения; Короткая кинетика обратной полярности наблюдалась возле ротового отдела позвоночника, что, по-видимому, не было упущено в предыдущих исследованиях с помощью световой микроскопии.
=== Эндосимбиоз ===
Исследования образцов с разных глубин, в частности более глубокого бескислородного слоя меромиктического швейцарского озера Цуг, проведенные Графом «и др.», привели к открытию в 2021 году бескислородных Gammaproteobacteria | Gammaproteobacteria «Ca.» Azoamicus ciliaticola, который возникает при эндосимбиозе | внутриклеточный симбиоз с реснитчатым хозяином жив. name="Graf2021"/> Дальнейшие примеры таких симбиозов с бактериальными эндосимбионтами родов Ca. Azoamicus и Ca. Azosocius (оба семейства Ca. Azoamicaceae) были обнаружены с помощью метагеномики в подземных водах. образцы из Хайниха Метагеномные данные указывают на инфузорных хозяев отряда Odontostomatida.
Инфузорный хозяин «Ca.» Azoamicus ciliaticola, по-видимому, не содержит каких-либо реальных функциональных митохондрий, а скорее метаболически редуцированных митохондрий#MRO|органелл, связанных с митохондриями.
Филогенетический анализ показал, что эти одонтостоматидные инфузории принадлежат к классу Plagiopylea. Чрезвычайно редуцированный геном эндосимбионтов указывает на их длительный вертикальный перенос генов|вертикальное наследование в этом отряде инфузорий.
Бактерии семейства Ca. Azoamicaceae, по-видимому, развили минимальный набор генов для генерации АТФ с использованием денитрифицирующей и кислородной дыхательной цепи. Фактически, консервативные коровые гены составляют более 80% белкового набора самых маленьких геномов этого семейства.
Вместо этого необходимые бактериям белки кодируются в геноме генетического кода инфузории-хозяина, а трансляционные (биологические)|сгенерированные белки затем вводятся в бактерии посредством биосинтеза белков#proteintargeting_and_proteintransport|нацеливания на белки.
Нацеливание на белки-хозяева уже было продемонстрировано в редких случаях в HBE насекомых, у Angomonas deanei (Trypanosomatidae) и особенно в хроматофоре Paulinella|Paulinella chromatophora, а также в нитропластах ( как бактерия Ca. Atelocyanobacterium thalassae) из Braarudosphaera bigelowii (Haptophyta). заметил.
Такие открытия по нацеливанию на белки стирают границы между HBE и органеллами; Azoamicaceae также могут представлять собой еще один пример перехода от бактериальных эндосимбионтов (HBE) к настоящим органеллам.
Бактериальные эндосимбионты рода «Ca.» Azosocius, в отличие от «Ca.» Azoamicus, по-видимому, не утратили способности дышать кислородом. Они, по-видимому, позволяют своему инфузорному хозяину существовать в условиях временного или постоянного существования. бедные кислородом условия − в отличие от ''Прим.'' Azoamicus в анозийской зоне озера Цуг.
=== Гипотезы о развитии эндосимбиозных отношений ===
По мнению Графа и др. (2021), симбиоз между бактериями Ca. Azoamicus и их хозяином Plagiopylea мог возникнуть следующим образом:
# Адаптация первоначально аэробной инфузории к бескислородной нитратсодержащей среде включала превращение ее аэробных митохондрий в гидрогеносомы. # Приобретение факультативно анаэробной денитрифицирующей гаммапротеобактерии, которая попала в анаэробного реснитчатого хозяина либо посредством эндоцитоза (2а), либо в виде паразита (2б) (в последнем случае предшественник «Ca.» Azoamicus ciliaticola уже содержал аденозин трифосфат| АТФ/аденозиндифосфат|АДФ-транслоказа для энергетики Паразитизм.
# Транслоказа АТФ/АДФ также могла быть получена позднее посредством латерального переноса генов (LGT), например, от ко-симбионта из класса Alphaproteobacteria. Длительные бескислородные и богатые нитратами условия могли привести к потере генов кислородного дыхания. В результате возник сегодняшний симбиоз между «Ca.» Azoamicus ciliaticola» и Plagiopylea incilates.
=== Значение ===
Эндосимбионты широко распространены среди анаэробных инфузорий. Высказано предположение, что важную роль в переходе инфузорий к анаэробному образу жизни (анаэробиозу) играют синтрофные эндосимбионты.
Благодаря своей способности к аэробному дыханию эти Azoamicaceae представляют собой интересный пример бактериального эндосимбионта инфузорий, который позволяет адаптироваться к микроаэробному образу жизни.
== Систематика ==
Согласно филогенетическому анализу Графа и др. (2021), среди Plagiopylea выделяют две клады: одна включает порядок Plagiopylida, другая включает, среди прочих. бескислородные инфузории из озера Цуг, а также общее семейство Epalxellidae, принадлежащее к отряду Odontostomatida, с видом Epalxella antiquorum. В этих условиях класс будет Odontostomatea Национального центра биотехнологической информации | Таксономия NCBI является синонимом Plagiopylea.
По состоянию: 20 декабря 2024 г.
Клада/подтип: Intramacronucleata: Ventrata(O,W) [CONthreeP]
* Класс: '''Plagiopylea''' ** Отряд: Odontostomatida *** Семейство Discomorphellidae **** Род Discomorphella ***** ''Discomorphella pectinata''ᵀ ***** ''Discomorphella pedroeneasi'' *** Семейство Epalxellidae **** Род '' Atopodinium ***** ''Atopodinium fibulatum''ᵀ **** Род ''Epalxella'' ***** ''Epalxella antiquorum'' ***** ''Epalxella exigua'' ***** ''Epalxella mirabilis''ᵀ ***** ''Epalxella striata'' **** Род Pelodinium ***** ''Pelodinium reniforme''ᵀ **** Род ''Saprodinium'' ***** ''Saprodinium dentatum''ᵀ ***** ''Saprodinium halophilum'' ***** ''Saprodinium integrum'' *** Семейство Mylestomatidae **** Род Mylestoma ***** ''Mylestoma anatinum'' ***** ''Mylestoma bipartitum'' **** без присвоения жанра
***** ***** *** без жанровой и семейной принадлежности
**** Клайд
***** [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LR798078.1 LR798078] Single_ciliate_S1
***** [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LR798080.1 LR798081] Single_ciliate_S3
***** [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LR798081.1 LR798081] Single_ciliate_S4
***** [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LR798089.1 LR798089] изолировать Environmental_sample/metagenome в сборе
***** [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LR798082.1 LR798082] Комбинированные_цилиаты_C5
***** [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LR798083.1 LR798083] Комбинированные_цилиаты_C10
**** Клайд
***** [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LR798079.1 LR798079] Single_ciliate_S2
** Отряд: '''Plagiopylida''' ***Семейство: Plagiopylidae . **** Род: ''Lechriopyla'' ***** ''Lechriopyla mystax''ᵀ **** Род: ''Paraplagiopyla'' . ***** ''Paraplagiopyla kiboko''ᵀ
* ''Plagiopyla binucleata'' * ''Plagiopyla cucullio'' * ''Plagiopyla frontata'' * ''Plagiopyla marina'' * ''Plagiopyla megastoma'' * ''Plagiopyla minuta'' * ''Plagiopyla narasimhamurtii'' * ''Plagiopyla nasuta''ᵀ * ''Plagiopyla ovata'' * ''Plagiopyla ramani'' * ''Plagiopyla rariseta'' * ''Plagiopyla Vesita'' * ''Плагиопила'' зр. F26(Н)
* ''Плагиопила'' зр. ФГ-2015(Н)
* ''Плагиопила'' зр. PHB07091001(N)
* ''Плагиопила'' зр. QZ-2012(N)
* ''Плагиопила'' зр. штамм F1A(N)
* ''Плагиопила'' зр. штамм JUDRED(N)
* ''Плагиопила'' зр. штамм OYSTR(N)
----
:::* Род: ''Pseudoplagiopyla'' :::** ''Pseudoplagiopyla sinistra''ᵀ :::* Род: ''Schizocaryum'' :::** ''Schizocaryum dogieli''ᵀ ::* Семейство: Sonderiidae ::** Род: «''Parasonderia''» ::*** ''Парасондерия кали'' ::*** ''''Парасондерия Вестита'' ::** Род: ''Sonderia'' ::*** ''Сондерия круглоротая'' ::*** ''Sonderia labiata'' ::*** ''Sonderia macrochilus'' ::*** ''Сондерия мира'' ::*** ''Sonderia pharyngea'' ::*** ''Сондерия шизостома'' ::*** ''Sonderia sinuata'' ::*** ''Сондерия трубчатая'' ::*** ''Сондерия Вестита'' ::*** ''Сондерия воракс'' ::** Род: ''Sonderiella'' ::*** ''Sonderiella scandens''ᵀ ::* Семейство: Trimyemidae
* ''Тримьема альфредкахли'' * ''Trimyema claviformis'' * ''Trimyema compressum''ᵀ * ''Тримиема трудная'' * ''Trimyema echinometrae'' * ''Trimyema finlayi'' * ''Trimyema foissneri'' * ''Тримьема кали'' * ''Тримиема корейская'' ** Ствол корейского языка — Местонахождение: гиперсоленая вода из солнечного солевого раствора Сеосин, [https://mapcarta.com/de/W471440360 Промышленный парк Сосин-мён и завод по производству соли]. Mapcarta (ru). Южная Корея
** Изолят Plagiopylea LT85_L8Нуклеотиды NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC487870.1 … Изолят Plagiopylea LT85_L8 …]. Номер доступа: KC487870. – Местоположение: озеро Тиррелл, Австралия
** Изолят Plagiopylea LT85_G13Нуклеотиды NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC487772.1 … Изолят Plagiopylea LT85_G13 …]. Номер доступа: KC487772. – Местонахождение: озеро Тиррелл, Австралия
** Изолят Plagiopylea LT85_G24Нуклеотиды NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC487781.1 … Изолят Plagiopylea LT85_G24 …]. Номер доступа: KC487781. – Местонахождение: озеро Тиррелл, Австралия
** Изолят Plagiopylea LT85_B18Нуклеотиды NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC487685.1 … Изолят Plagiopylea LT85_B18 …]. Номер доступа: KC487685. – Местонахождение: озеро Тиррелл, Австралия
* ''Trimyema marinum'' * ''Trimyema minutum''(N) с ''Trimyema minutum thermophilum''(N)
** Изолировать EV10
* ''Trimyema pleurispirale'' * ''Trimyema shalsia'' * ''Тримьема'' сп. Озеро6(N) – Местоположение: Гиперсоленая вода, Уайалла, Австралия
* ''Тримьема'' сп. OH3A(N) – Местоположение: Солтон-Си, Калифорния
* ''Тримьема'' сп. S11B(N) – Местонахождение: гиперсоленая среда, залив Шарк, Австралия
* ''Тримьема'' сп. S13B(N) – Местонахождение: гиперсоленая среда, залив Шарк, Австралия
* ''Тримьема'' сп. S15B(N) – Местонахождение: гиперсоленая среда, залив Шарк, Австралия
* ''Тримьема'' сп. SD1A(N) – Местоположение: гиперсоленая среда, Чула-Виста, Калифорния
* ''Тримьема'' сп. штамм FARO3(N) – Местоположение: Квелфес, Португалия
* ''Тримьема'' сп. штамм FRESH(N) – Местоположение: Фалмут (Массачусетс)
* ''Тримьема'' сп. штамм JUD81(N) – Местоположение: Наррагансетт (Род-Айленд)
----
:(N) – Таксономия
О) – :(T) – Таксономикон. Универсальная таксономическая служба, Звааг, НидерландыЖ) – :? – неуверенно:ᵀ – типовой вид
== Примечания ==
Большая часть ресничек инфузорий организована в монокинетиды и дикинетиды, каждая из которых имеет одну или две кинетосомы (базальные тельца), каждая из которых может нести ресничку. Они расположены рядами, кинетиями (
* Бенджамин Томпсон, Ник Петрич Хоу: [https://www.nature.com/articles/d41586-021-00570-6 COVID, 2020 год и год потерянных исследований]. Подкаст о природе ( * Уильям Х. Льюис, Тайс Дж. Г. Эттема | Тайс Дж. Г. Эттема: «Микробный брак, напоминающий митохондриальную эволюцию». В: «Природа», Band 591, 3. Март 2021, S. 375-376;
Национальный центр биотехнологической информации | Браузер таксономии NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/B ... e=3&unlock Plagiopylea], Подробности: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/B ... id=1249559 '''Plagiopylea''' Small & Lynn, 1985] (класс).
Национальный центр биотехнологической информации | Браузер таксономии NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=408070&lvl=3&keep=1&srchmode=3&unlock Odontostomatida], Подробности: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=408070 Odontostomatida] (заказ).
Национальный центр биотехнологической информации | Браузер таксономии NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=35111&lvl=3&lin=f&keep=1&srchmode=2&unlock Trimyemidae], Подробности : [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=35111 Trimyemidae] (семейство).
Национальный центр биотехнологической информации | Нуклеотид NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/EF526988 Некультивируемый клон морских эукариот MA1_3F12…]. Присоединение EF526988.
Национальный центр биотехнологической информации | Нуклеотид NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/ab902303 Некультивируемые эукариоты… клон: OD_A_2012Dec_100]. Аксессуар АВ902303.
ВОРМС. [https://marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=414717 Plagiopylea] (Класс).
WoRMS: [https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=163017 Odontostomatida] (Орден).
Биогеографическая информационная система океана|OBIS: [https://obis.org/taxon/414717 Plagiopylea Small & Lynn, 1985] (Класс).
Океаническая биогеографическая информационная система|ОБИС: [https://obis.org/taxon/163017 Odontostomatida Sawaya, 1940] (Заказ).
С. Дж. Бренды (Hrsg.): [http://taxonomicon.taxonomy.nl/TaxonTree.aspx?id=124145&src=0 Род Saprodinium Lauterborn, 1908 (простейший) Small & Lynn, 1985 (простейший)] . Универсальные таксономические службы (taxonomicon.taxonomy.nl). Стенд: 1 февраля 2024 г.
НИС: [https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/morpho/ciliopho/trimyema.htm ''Тримьема''] Лакей, 1925 год.
NIES: [https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/morpho/ciliopho/discomor.htm ''Discomorphella''] Корлисс, 1960 год.
НИС: [https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/morpho/ciliopho/atopodin.htm ''Atopodinium''] Каль, 1932 год.
НИС: [https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/morpho/ciliopho/pelodini.htm ''Пелодиниум''] Лаутерборн, 1908 год.
NIES: [https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/morpho/ciliopho/epalxell.htm ''Epalxella''] Корлисс, 1960 год.
НИС: [https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/morpho/ciliopho/mylestom.htm ''Милестома''] Каль, 1928 год.
НИС: [https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/morpho/ciliopho/saprodin.htm ''Сапродиниум''] Лаутерборн, 1908 год.
NIES: [https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/refere/id4999/4327.htm Идентификатор ссылки: 4327]. Ханс-Гюнтер Шренк и Кристиан Ф. Барделе; Тонкая структура Saprodinium dentatum Lauterborn, 1908 как представителя Odontostomatida (Ciliophora). Дж.Протозоол. 38(3):278-293, 1991.
[https://www.гидро.uni-jena.de/72/hcze Исследование критической зоны Хайнича]. Йенский университет имени Фридриха Шиллера, факультет химических наук о Земле, кафедра гидрогеологии.
Бён Чхоль Чо, Чон Су Пак, Куйдон Сюй, Чжун Ки Чой: «Морфология и молекулярная филогения Trimyema koreanum n. sp., инфузории из гиперсоленой воды солнечной соли». В: «Эукариотическая микробиология», том 55, № 5, сентябрь – октябрь 2008 г., стр. 417-426;
* [https://mpi-bremen.de/en/New-form-of-symbiosis-discovered.html Обнаружена новая форма симбиоза]. Включено: Институт морской микробиологии Макса Планка (MPI-MM) с 3 марта 2021 г. ( ** [https://mpi-bremen.de/Neue-Form-der-Symbiose-entdeckt.html Обнаружена новая форма симбиоза].
Карла Б. Гейдельберг, Уильям К. Нельсон, Джоанна Б. Холм, Надин Айзенколб, Карен Андраде, Джоан Б. Эмерсон: «Характеристика эукариотического микробного разнообразия в гиперсоленом озере Тиррелл, Австралия». В: «Границы микробиологии». ', Том 4, , сек. Водная микробиология, 13 мая 2013 г.;
Ран Ли, Вэньбао Чжуан, Сяочэнь Фэн, Хантер Н. Хайнс, Сяочжун Ху: «Первое переописание и молекулярная филогения Trimyema claviforme» Каль, 1933 г. с описанием китайской популяции Plagiopyla nasuta Штейн, 1860 (Ciliophora, Plagiopylea)». В: «Европейский журнал протистологии», том 90, август. 2023, стр. 126003;
Летиция Модео, Сергей И. Фокин, Витторио Боскаро, Илария Андреоли, Филиппо Феррантини, Джованна Розати, Франко Верни, Джулио Петрони: «Морфология, ультраструктура и молекулярная филогения инфузории Sonderia vorax с пониманием систематики порядок Plagiopylida». В: «BMC Microbiology», Том 13, №40, февраль 2013 г., стр.40;
* Препринт на bioRxiv от 19 февраля 2024 г.; doi:10.1101/2024.02.19.580942.
** [https://www.eurekalert.org/news-releases/1067572?language=german Больше, чем просто кислород: разнообразие и метаболизм глобальных эндосимбионтов].
* [https://mpi-bremen.de/en/Oxygen-is-not-the-limit-Diversity-and-metabolic-potential-of-globally-distributed-endosymbionts.html Кислород i это не предел: Разнообразие и метаболический потенциал глобально распространенных эндосимбионтов]. Включено: Институт морской микробиологии Макса Планка (MPI-MM) с 9 декабря 2024 г. ( ** [https://mpi-bremen.de/Mehr-als-nur-Sauerstoff-Vielfalt-und-Stoffwechsel-globaler-Endosymbionten.html Больше, чем просто кислород: разнообразие и метаболизм глобальных эндосимбионтов].
Карл-Эрик Вегнер, Михаэль Гаспар, Патриция Гисинк, Мартина Херрманн, Манья Марц, Кирстен Кюзель: «Биогеохимические режимы в неглубоких водоносных горизонтах отражают метаболическое [url=viewtopic.php?t=31193]взаимодействие[/url] элементов азота, серы и углерода». В книге «Прикладные и экологические аспекты». Микробиология», том 85, №5, 20 февраля 2019 г.;
Юань Сюй, Чэнь Шао, Мяо Мяо, Weibo Song: «Переописание гребня Parasonderia Vesita» (Kahl, 1928). Ноябрь (Ciliophora, Plagiopylida) с примечаниями о его филогении на основе гена рРНК SSU». В: «Европейский журнал протистологии», том 49, № 1, январь 2013 г., стр. 106–113;
Категория: Инфузории
Подробнее: [url]https://de.wikipedia.org/wiki/Plagiopylea[/url]